Denní souhrn testů na COVID-19 a hodnocení indexu rizika pro Protiepidemický systém (PES) k 29. 4. 2021

Ministerstvo zdravotnictví denně aktualizuje souhrn provedených testů na COVID-19. Detaily včetně zveřejněné datové sady jsou k dispozici na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19.

Dne 28.04.2021 bylo provedeno 18 280 testů PCR a 146 166 antigenních testů, a to u 162 849 unikátních testovaných osob. Testy s preventivní indikací a prováděné v rámci plošného testování tvořily 81,6 % celkového počtu testů.

Celkem bylo potvrzeno 2 483 pozitivních diagnóz COVID-19, přičemž AG testy se na tomto záchytu podílely z 16,0 % (týdenní průměr podílu AG testů na pozitivních záchytech se pohybuje v rozsahu cca 20 %). COVID-19 byl prokázán u 1 162 asymptomatických osob, z toho v 206 případech na bázi AG testu následně potvrzeného vyšetřením PCR.

Testy se dle uvedené indikace vyšetření významně liší v dosahované pozitivitě záchytu nemoci COVID-19 (7denní průměrná pozitivita):

diagnostické a klinické indikace testů vykazují pozitivitu 13,9 %,
testy s epidemiologickou indikací (rizikové kontakty, trasování) mají 5,7% pozitivitu,
testy s preventivní indikací a při plošném testování dosahují 0,2% pozitivity

Od 6. 1. 2021 jsou denně aktualizovány hodnoty indexu rizika, který je kalkulován pro Protiepidemický systém (PES).

Hodnota indexu kalkulovaného na bázi nové metodiky je k 29.04.2021 51 bodů ze 100. Detaily jsou k dispozici na https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes. K vysoké hodnotě indexu přispívají všechny komponenty indexu, které nabývají vysokých hodnot, konkrétně:

· 14denní incidence na 100 tis. obyv.:	323,7
· 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+:	227,0
· Zjednodušené reprodukční číslo:	0,88
· Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě za posledních 14 dní:	40,1%

Číselné souhrny jsou uvedeny v následujících tabulkách a v datových přílohách této zprávy.

Přehled provedených testů

Denní souhrn za 28. 04. 2021 /generováno 29.04.2021/

Počet provedených (nahlášených) testů	Za 28. 04. 2021	Počet otestovaných osob*	Za 27. 04. 2021	Počet otestovaných osob*
PCR testů	18 280		19 747
Antigenní (Ag) testy	146 166	162 849	184 583	203 256
…z toho prvotesty	12 938		16 041

Počet pozitivních diagnóz COVID-19	Za 28. 04. 2021	… v %	Za 27. 04. 2021	… v %
Celkem	2 483	100%	3 239	100%
PCR – symptomatičtí pacienti	1 130	45,5%	1 519	46,9%
PCR – asymptomatičtí pacienti	956	38,5%	1 251	38,6%
Ag – symptomatičtí pacienti	191	7,7%	217	6,7%
Ag – asymptomatičtí pacienti /konfirmace PCR/**	206	8,3%	252	7,8%

Počet testů dle indikace	Za 28. 04. 2021	… v %	Za 27. 04. 2021	… v %
Celkem	164 446	100%	204 330	100%
Diagnostická indikace	8 738	5,3%	8 977	4,4%
Epidemiologická indikace	20 050	12,2%	24 685	12,1%
Preventivní a plošné testování	134 171	81,6%	168 973	82,7%
Ostatní	1 487	0,9%	1 695	0,8%

Relativní pozitivita testů dle indikace testu***	Za 28. 04. 2021	Za 27. 04. 2021	7denní průměr k 27. 04. 2021
Diagnostická indikace	12,5%	15,1%	12,8%
Epidemiologická indikace	4,9%	5,1%	5,6%
Preventivní a plošné testování	0,2%	0,2%	0,2%

Počet evidovaných testů	Za 7 dní k 28. 04. 2021	Za 7 dní k 27. 04. 2021	Celkem v databázi
PCR testy	108 654	109 260	6 732 825
Antigenní testy	978 725	1028 989	11 157 709

* Jeden klient může mít proveden Ag i PCR test, počet otestovaných osob není roven součtu testů

** Tyto testy nejsou zahrnuty v záchytech nemoci u testů PCR

*** Relativní pozitivita testů může být v posledním dni ovlivněna nedohlášením negativních testů v daném okamžiku (v případě velkého počtu testů jsou pro zpracování prioritizovány pozitivní testy a negativní testy jsou z laboratoří hlášeny postupně). Z toho důvodu dochází zpětně (cca 1–3 dny) ke korekcím průběžně hlášených hodnot.

Index rizika pro Protiepidemický systém PES: 29. 4. 2021*

INDEX RIZIKA k datu 29.04.2021: 51 bodů
Hodnota 28.04.2021: 51 bodů	Index se k 29. 4. 2021 v porovnání s předchozím dnem nezměnil.
Hodnota 27.04.2021: 54 bodů
Hodnota 26.04.2021: 54 bodů
Hodnota 25.04.2021: 54 bodů
Hodnota 24.04.2021: 54 bodů
Hodnota 23.04.2021: 54 bodů

Poznámka: U komponenty Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní) dochází ke zpětnému dohlašování hospitalizací a z toho důvodu se tato komponenta může změnit i pro již uplynulé dny. V případě, že se hodnoty pohybují v blízkosti bodové hranice, může tedy dojít i ke změně počtu bodů připočítaných za tuto komponentu a tím pádem i ke změně hodnoty celého indexu.

Komponenty indexu rizika	Hodnota	Počet bodů
14denní incidence na 100 tis. obyv.	323,7	13
14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	227,0	10
Zjednodušené reprodukční číslo	0,88	3
Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní)	40,1%	25
Nárůst 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	ne	0
Nárůst podílu hospitalizovaných nezachycených v komunitě	ne	0
CELKEM		51

* Index rizika je od 6. 1. 2021 kalkulován dle metodiky výpočtu publikované zde:
https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes

Doplňující metodický komentář k publikovaným datům o testování COVID-19

Datové sady s diagnostickými testy na COVID-19 jsou od 16. 11. 2020 doplněny dle mezinárodních metodik ECDC. Nově jsou do evropské definice potvrzeného případu zahrnuty také antigenní testy (AG). Detekce nukleové kyseliny nebo antigenu viru SARS-CoV-2 v klinickém vzorku je nyní laboratorním kritériem. ECDC v současnosti publikuje výpočet relativní pozitivity testů pro veškeré testy provedené v daném týdnu (jmenovatel). Čitatelem pro výpočet pozitivity testů je počet nově potvrzených případů v daném týdnu

https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/surveillance/case-definition
http://www.szu.cz/tema/prevence/definice-pripadu-case-definitiono-koronavirove-onemocneni
https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-testing

Doplnění datových sad zajišťuje shodu údajů s mezinárodně publikovanými daty, které ČR hlásí podle metodik ECDC do zahraničních databází. Jako testy určující denní počet nově diagnostikovaných případů jsou nadále uvažovány pouze testy primárně pozitivní. V ČR situaci významně změnilo zavedení opakovaného plošného testování AG testy jako modality plně hrazené z veřejného zdravotního pojištění. Počty vykazovaných AG testů již nyní dosahují úrovně řádově srovnatelné s testy PCR. Prováděné AG testy se z velké části týkají preventivních vyšetření a mění spektrum testovaných u PCR testů: vysoký podíl klinických indikací zvyšuje jejich pozitivitu. Narůstá diverzita indikací k testování COVID-19 a zvyšuje se dostupnost a denní počet prováděných testů. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci spojováním dat různých testů a různých indikací není nadále smysluplné. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci tak musí rozlišovat především důvody pro vyšetření, cílové skupiny, různé indikace testů a klinickou závažnost stavu pacientů.

Doplňující metodický komentář k antigenním testům

Testy pro průkaz antigenu musí pro použití v ČR splňovat požadavky na kvalitu, senzitivitu >90% a specificitu >97% (cca u 3 % může jít o falešně pozitivní nález). Používané testy musí mít evropskou certifikaci CE IVD. V ČR jsou využívány antigenní testy více výrobců. Všechny dosud používané testy včetně odběru biologického materiálu musí provádět zdravotnický pracovník. Správnost a kvalita odběru materiálu na vyšetření je zásadní pro úspěšnost testu. Výsledek vyšetření antigenním testem vypovídá pouze o situaci ve chvíli odběru vyšetřovaného materiálu.

V situaci s vysokou prevalencí (přítomností) infekce v populaci lze pomocí testů na průkaz antigenu detekovat infekčního jedince v komunitě a včas snížit tlak na zdravotní péči. V takové chvíli je riziko neodhalení všech případů (riziko falešně negativních výsledků) vyváženo včasností výsledků a možností sériového testování jednotlivců. Při interpretaci výsledku antigenního testu je nutné pracovat s informací, že:

práh detekce testu neumožňuje identifikovat přítomnost SARS-CoV-2 u cca 30–50 % jedinců bez příznaků onemocnění COVID-19, ale přitom tito vykazují pozitivitu metodou PCR
u osob s příznaky onemocnění není diagnóza COVID-19 antigenním testem stanovena cca u 25 % případů (možnost i jiného respiračního onemocnění)
negativní výsledek antigenního testu tak nevylučuje možnost, že jedinec je infekční anebo že se stane infekčním v blízkém časovém odstupu od vyšetření

Využití antigenních testů pro hromadné testování je užitečné pro odhalení lidí s vysokou produkcí viru, kterým je dále poskytnuta cílená zdravotní péče, a především poučení o opatřeních, která musí dodržovat, aby zabránili ohrožení dalších osob ve svém okolí. Důležitý je pozitivní výsledek. Negativní výsledek však infekci nevylučuje.