Denní souhrn testů na COVID-19 a hodnocení indexu rizika pro Protiepidemický systém (PES) k 14. 3. 2021

Dne 13. 3. 2021 bylo provedeno 16 439 testů PCR a 41 253 antigenních testů, a to u 57 288 unikátních testovaných osob. Testy s preventivní indikací a prováděné v rámci plošného testování tvořily 71,7 % celkového počtu testů.

Celkem bylo potvrzeno 6 914 pozitivních diagnóz COVID-19, přičemž AG testy se na tomto záchytu podílely z 16,3 % (týdenní průměr podílu AG testů na pozitivních záchytech se pohybuje v rozsahu cca 20 %). COVID-19 byl prokázán u 3 077 asymptomatických osob, z toho v 621 případech na bázi AG testu následně potvrzeného vyšetřením PCR.

Testy se dle uvedené indikace vyšetření významně liší v dosahované pozitivitě záchytu nemoci COVID-19 (7denní průměrná pozitivita):

diagnostické a klinické indikace testů vykazují pozitivitu 38,1 %,
testy s epidemiologickou indikací (rizikové kontakty, trasování) mají 18,0 % pozitivitu,
testy s preventivní indikací a při plošném testování dosahují 1,0 % pozitivity

Od 6. 1. 2021 jsou denně aktualizovány hodnoty indexu rizika, který je kalkulován pro Protiepidemický systém (PES).

Hodnota indexu kalkulovaného na bázi nové metodiky je k 14.03.2021 71 bodů ze 100. Detaily jsou k dispozici na https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes. K vysoké hodnotě indexu přispívají všechny komponenty indexu, které nabývají vysokých hodnot, konkrétně:

· 14denní incidence na 100 tis. obyv.:	1 528,4
· 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+:	1 096,8
· Zjednodušené reprodukční číslo:	0,93
· Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě za posledních 14 dní:	41,4 %

Číselné souhrny jsou uvedeny v následujících tabulkách a v datových přílohách této zprávy.

Přehled provedených testů

Denní souhrn za 13.03.2021	/generováno 14.03.2021/

Počet provedených (nahlášených) testů	Za 13.3.	Počet otestovaných osob*	Za 12.3.	Počet otestovaných osob*
PCR testů	16 439	57 288	39 134	147 169
Antigenní (Ag) testy	41 253		110 584
…z toho prvotesty	58 337		71 032

Počet pozitivních diagnóz COVID-19	Za 13.3.	… v %	Za 12.3.	… v %
Celkem	6 914	100%	14 946	100%
PCR – symptomatičtí pacienti	3 331	48,2%	6 825	45,7%
PCR – asymptomatičtí pacienti	2 456	35,5%	4 524	30,3%
Ag – symptomatičtí pacienti	506	7,3%	2 540	17,0%
Ag – asymptomatičtí pacienti /konfirmace PCR/**	621	9,0%	1 057	7,1%

Počet testů dle indikace	Za 13.3.	… v %	Za 12.3.	… v %
Celkem	57 692	100%	149 718	100%
Diagnostická indikace	10 084	17,5%	23 965	16,0%
Epidemiologická indikace	5 075	8,8%	13 565	9,1%
Preventivní a plošné testování	41 340	71,7%	109 265	73,0%
Ostatní	1 193	2,1%	2 923	2,0%

Relativní pozitivita testů dle indikace testu***	Za 13.3.	Za 12.3.	7denní průměr k 12.3.
Diagnostická indikace	41,2%	43,0%	38,8%
Epidemiologická indikace	24,2%	18,9%	18,1%
Preventivní a plošné testování	1,7%	1,0%	1,1%

Počet evidovaných testů	Za 7 dní k 13.3.	Za 7 dní k 12.3.	Celkem v databázi
PCR testy	214 399	219 943	5 809 683
Antigenní testy	702 038	693 415	3 852 876

* Jeden klient může mít proveden Ag i PCR test, počet otestovaných osob není roven součtu testů

** Tyto testy nejsou zahrnuty v záchytech nemoci u testů PCR

*** Relativní pozitivita testů může být v posledním dni ovlivněna nedohlášením negativních testů v daném okamžiku (v případě velkého počtu testů jsou pro zpracování prioritizovány pozitivní testy a negativní testy jsou z laboratoří hlášeny postupně). Z toho důvodu dochází zpětně (cca 1 – 3 dny) ke korekcím průběžně hlášených hodnot.

Index rizika pro Protiepidemický systém PES: 14. 3. 2021*

INDEX RIZIKA k datu 14.03.2021: 71 bodů
Hodnota 13.03.2021: 73 bodů	Důvodem poklesu hodnoty k 14. 3. 2021 je zastavení rostoucího trendu ve 14denní incidenci 65+ (kalkulováno na 100 tis. obyvatel ve věku 65+).
Hodnota 12.03.2021: 73 bodů
Hodnota 11.03.2021: 73 bodů
Hodnota 10.03.2021: 73 bodů
Hodnota 09.03.2021: 73 bodů
Hodnota 08.03.2021: 76 bodů

Poznámka: U komponenty Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní) dochází ke zpětnému dohlašování hospitalizací a z toho důvodu se tato komponenta může změnit i pro již uplynulé dny. V případě, že se hodnoty pohybují v blízkosti bodové hranice, může tedy dojít i ke změně počtu bodů připočítaných za tuto komponentu a tím pádem i ke změně hodnoty celého indexu.

Komponenty indexu rizika	Hodnota	Počet bodů
14denní incidence na 100 tis. obyv.	1 528,4	20
14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	1 096,8	20
Zjednodušené reprodukční číslo	0,93	6
Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní)	41,4 %	25
Nárůst 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	ne	0
Nárůst podílu hospitalizovaných nezachycených v komunitě	ne	0
CELKEM		71

* Index rizika je od 6.1. 2021 kalkulován dle metodiky výpočtu publikované zde: https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes

Doplňující metodický komentář k publikovaným datům o testování COVID-19

Datové sady s diagnostickými testy na COVID-19 jsou od 16. 11. 2020 doplněny dle mezinárodních metodik ECDC. Nově jsou do evropské definice potvrzeného případu zahrnuty také antigenní testy (AG). Detekce nukleové kyseliny nebo antigenu viru SARS-CoV-2 v klinickém vzorku je nyní laboratorním kritériem. ECDC v současnosti publikuje výpočet relativní pozitivity testů pro veškeré testy provedené v daném týdnu (jmenovatel). Čitatelem pro výpočet pozitivity testů je počet nově potvrzených případů v daném týdnu

https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/surveillance/case-definition
http://www.szu.cz/tema/prevence/definice-pripadu-case-definitiono-koronavirove-onemocneni
https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-testing

Doplnění datových sad zajišťuje shodu údajů s mezinárodně publikovanými daty, které ČR hlásí podle metodik ECDC do zahraničních databází. Jako testy určující denní počet nově diagnostikovaných případů jsou nadále uvažovány pouze testy primárně pozitivní. V ČR situaci významně změnilo zavedení opakovaného plošného testování AG testy jako modality plně hrazené z veřejného zdravotního pojištění. Počty vykazovaných AG testů již nyní dosahují úrovně řádově srovnatelné s testy PCR. Prováděné AG testy se z velké části týkají preventivních vyšetření a mění spektrum testovaných u PCR testů: vysoký podíl klinických indikací zvyšuje jejich pozitivitu. Narůstá diverzita indikací k testování COVID-19 a zvyšuje se dostupnost a denní počet prováděných testů. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci spojováním dat různých testů a různých indikací není nadále smysluplné. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci tak musí rozlišovat především důvody pro vyšetření, cílové skupiny, různé indikace testů a klinickou závažnost stavu pacientů.

Doplňující metodický komentář k antigenním testům

Testy pro průkaz antigenu musí pro použití v ČR splňovat požadavky na kvalitu, senzitivitu >90% a specificitu >97% (cca u 3 % může jít o falešně pozitivní nález). Používané testy musí mít evropskou certifikaci CE IVD. V ČR jsou využívány antigenní testy více výrobců. Všechny dosud používané testy včetně odběru biologického materiálu musí provádět zdravotnický pracovník. Správnost a kvalita odběru materiálu na vyšetření je zásadní pro úspěšnost testu. Výsledek vyšetření antigenním testem vypovídá pouze o situaci ve chvíli odběru vyšetřovaného materiálu.

V situaci s vysokou prevalencí (přítomností) infekce v populaci lze pomocí testů na průkaz antigenu detekovat infekčního jedince v komunitě a včas snížit tlak na zdravotní péči. V takové chvíli je riziko neodhalení všech případů (riziko falešně negativních výsledků) vyváženo včasností výsledků a možností sériového testování jednotlivců. Při interpretaci výsledku antigenního testu je nutné pracovat s informací, že:

práh detekce testu neumožňuje identifikovat přítomnost SARS-CoV-2 u cca 30–50 % jedinců bez příznaků onemocnění COVID-19, ale přitom tito vykazují pozitivitu metodou PCR
u osob s příznaky onemocnění není diagnóza COVID-19 antigenním testem stanovena cca u 25 % případů (možnost i jiného respiračního onemocnění)
negativní výsledek antigenního testu tak nevylučuje možnost, že jedinec je infekční anebo že se stane infekčním v blízkém časovém odstupu od vyšetření

Využití antigenních testů pro hromadné testování je užitečné pro odhalení lidí s vysokou produkcí viru, kterým je dále poskytnuta cílená zdravotní péče, a především poučení o opatřeních, která musí dodržovat, aby zabránili ohrožení dalších osob ve svém okolí. Důležitý je pozitivní výsledek. Negativní výsledek však infekci nevylučuje.